Tại một cơ sở nghiên cứu ẩn mình trên một hòn đảo xa xôi hẻo lánh, lập trình viên thiên tài Shiki Magata đã sống một cuộc sống biệt lập rất nhiều năm. Cô hiếm khi gặp khách, nhưng giáo sư Souhei Saikawa và bạn sinh viên Moe Nishinosono vẫn tìm đến cô. Tuy nhiên, họ đã bị cuốn vào một vụ giết người trong phòng kín bí ẩn.